Labyrintti - Aavikkokokeet
Thomas ja kaikki muut, jotka selviytyivät labyrintista heräävät uuteen ja aivan erilaiseen arkeen. Ryhmä löytää itsensä lukitusta rakennuksesta, jossa heille tarjotaan ruokaa ja uusia vaatteita. Näyttää myös siltä, että siellä asuu muita nuoria, jotka ovat myös selviytyneet labyrintista, ja jotka odottavat jo innolla parempaa tulevaisuutta. Mutta pian Thomas jo huomaa, että jotain on huonosti, sillä salaperäisellä ja vaikutusvaltaisella järjestöllä WCKD näyttää olevan pahoja takaa-ajatuksia. Sen takia ryhmä päättää paeta, joka johtaa vielä pahempiin haasteisiin vaarallisella alueella, jota kutsutaan Infernoksi. Siellä heidän täytyy mm. taistella zombiemaisia olentoja vastaan, joiden purema on kuolettava – ja kaikki tämä tapahtuu samaan aikaan kun WCKD seuraa heitä.
